» こんにちは。はじめまして。

はて、ムラムラというのはドットみたいになってるのでしょうか？

「透明の分割」時の設定解像度が低かったとか、
「透明の分割」実行後にオブジェクトを結構拡大したとか…

まぁ、ラスタライズのうちかと思います。

いかがでしょうか？

» 効果メニューのラスター効果設定をデフォルトの72dpiのままに
していませんか？

この設定は忘れられがちなのですが、効果メニューでの
ドロップシャドウを使ったときは、この設定を高解像度350dpi
などに変更しておかないと、出力時に低い解像度でラスタライズされて
しまいます。

書類設定の透明効果の分割設定を正しくしていても
効果メニューの設定に関してはこちらかイキになりますので
ご注意ください。