保存状態が戻ってしまう

イラストレータ10.0使用 フォトショップ5.0使用
書類設定、用紙設定して、画像をリンク配置した
デザインを再度開くと設定が崩れていてまた用紙設定をしなおさなくてはなりません。
また、画像も消えていて更新し直しです。そうでないファイルの場合の時もあります。
どうしてでしょうか?すごく初歩的なミスをしているかもしれないのですが・・・
大変困惑しています。よろしくお願い致します。
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10.0.3にアップしてみるとか…。