PDFで文字が太る

教えてください。
IndesignからPDFを書き出した所(全部で50ページ)、PDF上でですが、部分的に文字が太って書き出されてしましました。
フォントは小塚を使っています。

PDFから印刷をしたところ問題なさそうなのですが、TouchUPで触った所、文字が何重にも重なってしまっていました。
数箇所なら手で直しますが、量が多すぎて消せません。

こういう現象がおきないようにPDFを作成したいのですが、何か原因分る方いらっしゃいますか?
» 001
どんなPDFを書き出したのですか?
印刷(製版)用データなら、私は、INDESIGNからPDF-X1aで書き出していますが。
» 002
どうしたらそういうことが起きるのか教えて下さい
Indesignのバージョンは?
PDFの書き出し設定は?
» 003
IndesingはCS2を使っています。
PDF納品だったんですが、印刷用ではないので、PDF-Xは使いませんでした。
高品質印刷やプレス、標準で作ってみました。

PDF-Xを使った方が良いのでしょうか?
» 004
透明が原因って事はないですか?

PDF-X1aで書き出せば大丈夫だったと思います。