質問があります。
Mac OS9でIllustrator8（以下イラレ）を使用してDTPをしているものです。

イラレ上でEPS画像を重たいのから軽いあたりデータにリンクを差し替えようと軽いデータのEPSファイル名をリンクしている画像名と同じにして、フォルダーの名前を変更して一気にリンクを差し替えると、イラレデータを開いた時に画像のレイアウトが崩れてしまいます。

これは何か誤操作をしているからなのでしょうか？

それとも仕方がないことなのでしょうか？

もし解決策をご存知の方がいらっしゃいましたら、
どうかご指導お願い申し上げます。