pdfが、謎のデータサイズ縮小

いつもお世話になっております。
表題の件ですが、Indesign CS→Distiller 5.0より書き出した
pdfデータ(A)を、同数ページのダミーデータ(B)上に、
「ページの置換」で全ページ張り替えたところ、
どういう訳かデータサイズが半分程になってしまいました。
サイズが小さくなるのは願ったり叶ったりなのですが、
万が一、必要な情報までなくなっていたらと考えると…。
問題はありませんでしょうか?
下記に、現在までの検証状況をお伝えします。

●作業環境はOSX(10.3.9)/OS9.2.2、Acrobat5.0、
 Acrobat Ditiller 5.0、IndesignCS(3.0.1J)
●作業の流れは以下の通りです。
 1 OSX(10.3.9)/IndesignCS(3.0.1J)でps書き出し
 2 OS9.2.2/Acrobat Ditiller 5.0でpdfを生成
 3 Acrobat5.0上で全ページ置換
●フォントの埋め込み方法や、画像サイズ、RGB使用など、
 Web用に最適化済みのデータです。
●(B)については、(A)をコピーしたもの(つまり、全く同じデータ)
 でも同様の結果が得られました。
●(A)を別名保存しても、サイズの変化はありませんでした。
●(A)と(B)を比較しても、使用フォント、画像解像度
 変化は見受けられませんでした。
Acrobat6.0.3では、同様の現象は見られませんでした。

以上です。
よろしくご教示の程、お願い致します。
» 001
あくまで推測なのでそこんとこよろしく。

ペーストボードにある余分なオブジェクトやInDesignのレイアウトでは隣のページにまたがっていてPDF時にページをばらしても見えないところに存在したオブジェクトが無駄な容量になっている場合があります。
それらが面付時に消えたのではないでしょうか。