> こんにちは．
> 100頁ほどのPDFがありまして，それにはしおり機能がついています．
> 50をクリックすると50ページ目のPDFが表示されるのですが，
> 再版がかかってある頁は修正が入っていまい，当然そこの頁のPDFも差し替えとなっていまします．
> このとき，新しいPDFに差し替えるにはどうしたらよいのでしょうか？
>
> よろしくお願いします．

修正終わったデータで新しくPDFを作って、
元のPDFから「ページの置換」かな。