色味が違うのはモニタ上ですか、それともプリント結果ですか。
プリント結果なら、書き出しデータというより、アクロバットのカラー設定の違いかもしれません。
アクロバット４と５の、編集→環境設定→一般のカラータブを開いて比較してみては？

ご返答ありがとうございます。
色味の違いは、画面上も出力紙も両方です。
4.0のカラー設定と5.0のカラー設定を比較したのですが、そもそも表示される項目が4.0と5.0では違い、設定をまったく同じに合わせることができませんでした。
一般設定の“互換性のある形式”を「Acrobat3.0」にすると、きちんと色は再現されるのですが、もちろんフォントが埋め込まれません…。

> 4.0のカラー設定と5.0のカラー設定を比較したのですが、そもそも表示される項目が4.0と5.0では違い、設定をまったく同じに合わせることができませんでした。

私は5.05しか持っていませんが、5の一般→カラーマネジメントの項目で「アクロナット４のカラー設定に合わせる」という項目が選べます。
4ならちゃんと色が出るのなら、ここの項目を「４に合わせる」で試したらどうでしょう。
私の場合はDTP業務なので、illustratorもPhotoshopも「プリプレスジャパン」、アクロでも同様なカラー設定をしています。
カラー設定ですから、文字うめ込みの可否には関係ありません。
> 一般設定の“互換性のある形式”を「Acrobat3.0」にすると、きちんと色は再現されるのですが、もちろんフォントが埋め込まれません…。

> 私は5.05しか持っていませんが、5の一般→カラーマネジメントの項目で「アクロナット４のカラー設定に合わせる」という項目が選べます。

当方、5.01でして、そのような設定がないようです。
5.01はpagemaker7.0をインストールした際に一緒にインストールされたもので、その辺の問題もあるのでしょうかね？
5.05にアップグレードできるんですか？

> 当方、5.01でして、そのような設定がないようです。

無いわけないと思いますが。
よく調べてください。（コマンド+Ｋ）

> 5.05にアップグレードできるんですか？

以下よりアップデータをダウンロード
http://www.adobe.com/jp/support/downloads/acr55upmac.html


本題ですが、Distiller 4.0のjob optionは、何にしてありますか？

何か勘違いがあるのではないかと思うのですか。
書き出したPDFはAclobatビューで開いて見ているのですよね。そこで色味が違うのでしょ。distillergrでは開けませんよね。
そこでillustrator、Photoshop、Distillerのjobオプション、そしてAclobatビューのカラー設定を全部そろえてみてください。
私が言ったカラーマネージメント項目とは、Aclobat→編集→一般→カラーマネージメントのことです。
これが４と５が同じかどうかということですが……

> 私は5.05しか持っていませんが、5の一般→カラーマネジメントの項目で「アクロナット４のカラー設定に合わせる」という項目が選べます。

申し遅れましたが、これを試したんですけど、やはりダメでした。
かなり明るい色（RGBっぽく）変換されてしまうのです。
ちなみにAcrobatは4.0しかもっていません。

> ちなみにAcrobatは4.0しかもっていません。

え！　でもDistirerは５なんでしょ？
DistirerってAcrobatに付属するソフトですよね。だったら本体のAcrobat本体はお持ちのはずですが？
もしかしてAcrobat Readerと勘違いしてる？

>5.01はpagemaker7.0をインストールした際に一緒にインストールされたもので、その辺の問題もあるのでしょうかね？
とおっしゃっていますね。製品版のAcrobatではないようです。
＃5.01なんてバージョンがあること初めて知りました。

＞ブリ瀧さん
まずは、［おやじ］様のおっしゃるように、5.05にアップデートしてください。
あと、気になっているのですが、4.05からNewCIDフォントなら埋め込みできますよ。ひょっとしたら2バイトTrueTypeを埋め込もうとなさっているのでしょうか。

> >5.01はpagemaker7.0をインストールした際に一緒にインストールされたもので、その辺の問題もあるのでしょうかね？
> とおっしゃっていますね。製品版のAcrobatではないようです。

そうなんですよ。
「製品版を買え」ってことですかねぇ…。

> まずは、［おやじ］様のおっしゃるように、5.05にアップデートしてください。

えぇ、やろうと思ったんですけど「Acrobat5がないからできません」と、エラーが出てしまいました。

> あと、気になっているのですが、4.05からNewCIDフォントなら埋め込みできますよ。ひょっとしたら2バイトTrueTypeを埋め込もうとなさっているのでしょうか。

いえ、ちゃんとNEW CIDです。
4.0ですとフォントフォルダにフォントが入っていることが条件ですよね？
（ATM Deluxeで管理しているため、フォント関係は別フォルダにおいてあります）
出し入れや再起動の行程がどうしても面倒で、5.0に頼りたくなってしまうんです。

いやぁ～参りました。

> 「Acrobat5がないからできません」と、エラーが出てしまいました。
あーそうか。「Distillerのアップデータ」ではなく「Acrobatのアップデータ」ですもんね。

製品版を買う・・・とはいってももう5は売っていないし。OSは9.2ですよね？5を入れるしかないし。どなたかから譲っていただくか、頑張って新古品を探すか。

面倒でも再起動して4でやるか、現在のフォント管理体系を変えるか。
どの方法を使っても大変ですね。
私なら、確実で、実績もある4で作業しますかね・・・。

Distirerだけのおまけソフトでしたか！
どうも噛み合わないとおもってました。