プラグインの読み込み・・・
どう考えても不要なファイルから試してみてください。
その後、動作が不安定になったら元の場所へ戻してください。
フォルダ
C:\Program Files\Adobe\Adobe Illustrator CS2\プラグイン
起動時間を短縮したいという意図でしょうか?
それであればWindows起動時に一緒に起動させてしまうのも手です。
(2回目以降の起動は早いので)
プラグインを絞るのならフォントも並行してやるべきかも。
Photoshopだと驚速で起動が速くなります、というか挙動が面白いです。
Illustratorでも効くようになるといいのですが。
Vistaではそのあたりの技術も進むかもしれない、と期待しています。