> PDF(X-1a)で保存し、

てことで、フォント埋込みかアウトライン。画像埋込み。透明なしなら
ちゃんとしたPDF出力の設定で書き出されているのなら、画像はそのままオフセット印刷のデータとして使えるかと考えていたのですが、問題点は

１　解像度についての制限がない。　解像度が足らない場合がある。
２　CMYK+特色を含んでいる場合がある。
３　オーバープリントの誤りについてチェックしてない。
４　断ち落しについては考えて無い。

特色と　元データの解像度が足らない場合の責任問題がありますが単純に　配置して　オフセット用に出力じゃダメなのかな。
プリンターで出力して　特色がでなければ　解像度が問題か。

>それをIllustratorで開いてラスタライズし

ここの「Illustratorでのラスタライズ解像度の設定」はどうなっていますか？

ラベルマイティに配置してある画像がもともと画質が低い
PDF変換設定で、折角画像が高解像度、
Illustratorでのラスタライズの高解像度　結果、見た目の画質が低い

ラベルマイティに配置してある画質が高い
PDFの画像が高い解像度、
Illustratorでのラスタライズの解像度低い　結果、画質が低い

など、いろいろな可能性ありますね。

【組合せ】
ラベルマイティーに配置してある画像の品質×
　PDFでの変換品質×
　Illustratorでのラスタライズ品質

PDF(X-1a)を、Acrobat（リーダーでも可）から画像を400％に拡大して、モザイクが見えないような状態ならなんとか使えると、吉田印刷さんのhpにありましたが。
http://blog.ddc.co.jp/mt/dtp/archives/20050725/172014.html

PDF変換で高い解像度にしても、元の解像度が低ければ、どうしようもないかと。

試しに、なにかPDF変換して　72dpiと400dpiの元データをIllustratorで作って，PDF変換して比較してみたらどうでしょう。ラベルマイティの元データが低解像度かどうか分る。

あと、ジャストシステムさんに相談。

ありがとうございます。
色々確認してみます。