バージョンが不明ですが、基本的にはそのやり方が正解だと思います。
ただ、最新のCCでは独立した角を選択し変形させる事が出来ます！
すごく楽ですよ！

バージョンはCS3です。CS3では角丸の角度を決めることが出来ますが、独立して選択は出来ません。
「すごく楽ですよ！」といわれると……心騒ぎます。
ありがとうございました。またよろしくお願いします。

四角の左上と右下の角を「はさみツール」（消しゴムツールの長押しで出ます）でクリック＞全体を選択ツールで選択＞効果＞スタイライズ＞角を丸くする＞半径を設定して、ＯＫ＞オブジェクト＞アピアランスを分割＞パスファインダパネル内の「形状エリアに追加」をＡｌｔ（Ｏｐｔｉｏｎ）を押したまままクリック。

おそらく、新しいバージョンでは、この操作が１回で出来る様になってると思います。
なので、はさみツールで切った後で、片側の角を選択して丸くすれば、１っ箇所だけが丸く出来ます。

出来ました!　操作説明の文字を追いながらの作業ですが、出来ました、出来ました！
小さな印刷屋さん、Hiroletaさん　有難うございました。

もう、みられていないかと思いますが…
私だったら・・・s.hさんのスクリプトでやりますね。
(いつも大変役に立っています)

角を丸くする＋
を使っています。

http://shspage.com/aijs/aics_scripts.zip
をダウンロードして解凍します

C:\Program Files (x86)\Adobe\Adobe Illustrator CS4\Presets\ja_JP\スクリプト　のようなデフォルトのところにスクリプト"角を丸くする+"を置いておきます。

丸くしたい角のみを選択して、"ファイル"メニューの"スクリプト"から"角を丸くする+"を選択すると、該当の部分だけ角が丸くすることができます。

S.hさんのスクリプトは、これ以外でも便利ですよ

Kuma705さん有難うございました。こんな便利なソフトがあるんですね。英語表示には困惑しましたが、判りやすい英語なので助かりました。開いたばかりで未だ何も出来ていませんが、ツールが沢山用意されていて、御馳走を前に舌舐めずりしているような気分です。　感謝します。