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IllustratorとMS-Officeとの連携には個別性が有るようです。
理由も解決法も分かりませんが、

http://Illustrator-ok.com/bbs_log/faq/contennts/faq_convert_1.htm#c2

こちらを参考にして下さい。

OS の違いによってもクリップボードの立ち振る舞いが多少違ったりしているようです。
ちょっと違いますが、私も Windows Me から Windowe XP に変えてから、
Excel から何故か英数文字のセルだけがコピー＆ペーストできなくなっている状態です。

私は Adobe Acrobat インストールして、「印刷」からを「Acrobat Distiller」を使う、
または「Adobe PDFへの変換」を使って、Excel（Word） データを PDF ファイルで書き出して、
その書き出した PDF ファイルを Illustrator で読み込む方法を取っています。

>Excel から何故か英数文字のセルだけがコピー＆ペーストできなくなっている状態です。

私は、Win-XP、Illustrator-10、Excel-2003環境ですが、英数文字のセルも問題なくペースト出来ましたが………。
なかなか一筋縄では行かないようですね。