簡単な冊子でも50ページもあるとイラレでは大変です。
初めてという方にイラレで作らせるとは、その印刷屋さんは鬼ですな(^^;)

それはさておき、初めてという方にはどこから説明したらいいのか…
設定というか、まずページの体裁をよく検討して組版ルールを決めて、それを
雛形ファイルにしてそれを基に各ページを作っていくといいでしょう（後から
体裁の変更があると地獄なので^^;）、くらいのことしか書けないです。

もう少し質問のポイントを絞ってもらえないとレスしにくいです。
ポイントが絞れないほど、という場合は入門書を購入された方がいいです(^^;)