InDesign CS2のバージョンは4.0.4でしょうか？
違っていたら、とりあえず4.0.4にアップデートしてみて下さい。

バージョンは4.0.4です。
友人に頼んで同じ作業をしてもらったところ、やはり同様の現象が起こるので、ソフト固有の問題のようです。しかたないのであきらめます。

ちなみに、おかしな現象というのは以下の作業で発生します。

1.新規ドキュメントを開き、レイアウトグリッドを選択
※サイズなどはすべてデフォのままでOK

2.フレームグリッドツールで、適当な文字ボックスを作る
※縦組でも横組でもOK

3.G5付属のテキストエディットで適当な文章を開き、
任意のテキストをそのボックスにコピーペーストする

4.その文字ボックスを、Optionを押しながらドラッグして複製する

5.複製されたボックスをフレームグリッド設定（コマンド+B）で
級数を大きくする（例えば24級などに）

6.級数の大きくなったボックスを、再びOption＆ドラッグで複製

7.その複製されたボックスを、またフレームグリッド設定で
級数を大きくする（例えば60級などに）

……この結果、級数が変わらずに５の時のままになる。

要は、Oprion&ドラッグでの複製法においては、
回数を重ねるとフレームグリッド設定の変更が出来なくなる、
ということです。

2.0の時は、フレームグリッドの設定を変えるたびに
「適用しますか？」というダイアログが出たのですが、
CS2では出ないのですね。

とりあえず、Option＆ドラッグではなく、
コピーペーストなら、問題は出ないようなので、
複製の際は気をつけることにします。

お騒がせしてすみませんでした。

WinXP sp2＋CS2（4.0.4）です。
現象確認しました。しかし、不具合が起きる場合と起きない場合があります。
今は、これ以上の検証をする時間がとれませんが、現象が起きた場合はグリッドフォーマットの適用でとりあえずは作業を続けられるかと。

いきさん、ありがとうございます。

おっしゃる通り、グリッドフォーマットの適用で何とか乗り切ろうと思います。
2.0の時は、基本的にグリッドフォーマットは使わない方式で、作業のベースを仕込まれたので、どうにも慣れた癖が抜けなくて…。

「郷に入っては郷に従え」ではありませんが、CS2に従うことにします。