はじめまして。Donnと申します。
私も今までに数回、InDesignにリンクして貼り付けた画像に劣化が生じた経験があります。こじ様と基本的に同じ環境でですが、一部OSが10.3.9の作業環境も混在しています。症状もおそらく同様の感じで、一定の幅で帯状にズレてしまいました。劣化した画像にはリンク後に手を加えたわけでもないのですが、出力をしたところズレているのに気づき、画像を開いてみたら劣化していました。実際にその症状が出たのがOS10.4.4の環境で、その後OSを10.4.8へアップしてからは同様の症状は出ていません。（たまたまその症状が出ていないだけかもしれないのですが。）
偶然の症状かと考えていたのですが、そうではないのでしょうか？

画像の劣化は、配置したIndesignドキュメント上ですでに発生しているものなのでしょうか？それとも出力したときなのでしょうか？スキャナで取り込み、tiff保存したもので、プレビュー画像が歪むというケースがありました。（出力したりPDF書き出し時には問題ありませんでした。）
またtiff保存時、圧縮設定はありますか？

私の場合は画像そのものが劣化していました。TIFFの保存時にはLZW圧縮を選択しています。

お返事遅くなりまして申し訳ございませんでした。
＞Donnさん
OSのアップグレード検討してみます。
以前OS　10.4.8は不安定という話を聞いたことがあったのですが、どうですか？安定していますか？

＞pi＆puさん
発生は一度ではなく幾度かありました。
画像は正常でInDesign上で表示が劣化しているもの（出力結果も同様の劣化がありました。）と
画像自体が劣化してしまうものとがありました。
画像はTIFFのLZW圧縮かけてます。

他の原因があるか
今ネットワークの可能性を調べています。
情報入りましたら報告させていただきます。
なにかありましたら、またお願い致します。