あんまり細かいことは言いたくないんですが……。
用語は正しく使った方が伝わりやすいと思います。
あと、この種の質問であれば必要ないだろうとは思いますが、解決の糸口になるべく最短でたどり着けるよう、環境とバージョンは書いた方がいいです。

ちょっと質問内容を書き換えてみます。違っていたらご指摘を。

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ペーストボード上でテキストフレーム内にテキストを入力して、予めレイアウトグリッドで設計しておいたマージン内にフレームを移動すると、テキストフレーム内に入力されているテキストがフレームから消えて（はみ出して）見えなくなってしまいます。ただし、ペーストボードにフレームを移動すると正常な位置にテキストが配置されています。
--------------ここまで--------------------

フレームグリッドに変換する、あるいはテキストに設定されているであろうグリッド揃えを「なし」にする。
いかがでしょうか。

ここがにちゃんねるなら、「日本語でおｋ」と一蹴されるところですが。

おそらく「グリッド揃え」を「なし」にすれば
解決しそうな問題じゃないかなと予想します。