MacBookPro17(2009)
MacOS10.5.7
InDesignCS3 5.0.4
illustratorCS3 13.0.2
PhotoshopCS3 10.0.1
Acrobatは7と8を併用しています。

上記のような環境で作業していますが，PhotoshopでM版をDIC160に置き換えるカラープロファイルを作りました。
その後InDesignでグレースケールaiのパーツを含んだレイアウトデータをPDF書き出しし，Acrobatの「色を置換」にてM版を特色に置き換えました。

すると，グレースケールのパーツが特色に置き換わったり置き換わらなかったりします。
InDesignでグレースケールを使った場合はほぼ間違いなく色が付きます。
かたやillustratorのパーツはAcrobatのバージョンによってグレースケールのままだったり，色が付いたりと挙動がいまひとつ不安定です。
解決策のヒントをいただければと思い書き込みさせていただきました。
よろしくお願い申し上げます。