OSX、CS4での症状です。
レイアウトグリッドに合わせたフレームグリッドを手動で作成すると、例えば10字×5行のグリッドが9字×6行のグリッドで作成されます（縦組み時）。また、同じ字詰め（1行の文字数）のグリッド二つ選び、同時に字詰めを変更しようとすると、片方にしか反映されません。
CS3を使っていたときにはなかったことなので、やりにくくて困っています。
CS4の不具合なのか、ファイルの問題なのか、環境設定などで解決できることなのか、御指南よろしくお願いします。