ちょっと状況がわからないんですが...
スクリプト（JS?）を使って、ノンブルだけに置換したいということでしょうか？　結果として必要なのは、ノンブルだけのテキストということでしょうか？
いくつものストーリーに別れているとか...

わたしなら、テキストをエディタにコピーして
^.+?([, ]+)$
$1
でノンブルだけのテキストにします。
答えになっているでしょうか？

せうぞーさん、回答ありがとうございます。

意図としては、ドキュメント内の頁番号の箇所へのハイパーリンクの作成
です。
数が多いですし、手動では間違いも起こりやすいため、スクリプトで
行いたいのですが、スクリプト初心者のため、大変苦戦している状況です。
とりあえず、頁番号を取り出せないと前に進まないため、質問させて
いただきました。

検索そのものは
http://d.hatena.ne.jp/seuzo/20090729/1248798401
ここの正規表現検索（の中の置換を外して参照を返すようにします）を使って参照を得て、それに対してリンクを作成することになろうかと思います。
リンクの作成方法はこちらを参照してください。
http://blog.dgcr.com/mt/dgcr/archives/20100222140200.html

このへんもたくさんコードが見られて参考になると思います。
http://forums.adobe.com/search.jspa?q=hyperlink&resultTypes=MESSAGE&dateRange=all&communityID=3331&username=

せうぞーさん、何度もありがとうございます。

紹介頂いたページを参考に色々やってみましたが、
素人の悲しさ、どんどん深みにはまっていっているようです。
一度、頭を整理してから再挑戦します。
進展がありましたら報告いたしますが、とりあえずお礼まで。