お世話になっております。
Mac OS X 10.5.6  InDesign CS3 (5.0.4)  Acrobat8.1.2 を使用しています。

<1>InDesignファイルを［PDF/X-1a:2001］形式でPDF書き出し。
<2>そのPDFを配置したInDesignファイルを再びPDF書き出し（PDF/X-1a:2001形式）。
という工程で印刷入稿する予定でおります。
不具合が生じる事がないか試作していた折り、さっそく不具合が生じてしまいました。

基本、配置するPDFは拡大縮小せずに100%で貼っていますが、
配置するPDF自体に、15%縮小したPDFが貼られているものがあります。
この縮小PDFにあるテキストが、<1>の段階のPDFではちゃんとあるのですが、
<2>の段階で消えてしまいました（InDesign上では表示されているのですが）。

PDF書き出しの設定項目の圧縮をオフにするなどしてみましたが、ダメでした。

ちなみに<2>の工程をPS書き出しにして、Distillerで変換したところ、問題なく表示されました。

配置するPDFを縮小する事に起因があるのか、そもそも再びPDFにする事がよろしくないのか、見当がつかずにおります。
何かご存知の方がいらっしゃいましたら、ご教示お願いいたします。