いつも参考にさせてもらっています。
Sing外字の不具合についてわかる方がいらっしゃいましたら教えてください。

環境は、MAC 10.4.11, InDesignCS3です。

Singの外字を使って、いくつかの外字を作り作業を進めてきたのですが、章ごとのファイルをブックにまとめて、ブックから全ページにわたるPDFを書き出そうとすると、
フォントの読み込みをしています。Sing外字が更新中でフォントがきちんと書き出されないかもしれません。といった感じのダイアログが出て、そのまま進めてしまうと、外字を埋め込んだ部分が、全部ではありませんが、他の外字と入れ替わってしまう事象が起こりました。

該当する外字は、１種類でしたが、読み方もコードもまったく違う外字と、使用した数ヶ所の文字がすべて入れ替わっていて、見つけた時は、原因がわからず、とても慌てました。

一ヶ所だけなら自分の操作ミスかとも思うのですが、すべての該当外字使用箇所にわたってなので、ソフト的なことだと思います。

外字自体は、文字パレットにも反映され、InDesignデータにもきちんと反映され、プリントアウトもできるのですが、ブックからのpdf書き出し時にエラーが起こるようです。

幸いブックを使わず、ファイル毎にPDFを書き出すと、そのようなダイアログも出ず、外字が入れ替わることもありません。

このまま外字を使って入稿しても大丈夫なのか、それとも外字はアウトライン化してしまった方が安全でしょうか。
入稿まであまり日がなく、事故が発生したので、たいへん心配になってきています。

InDesign自体がおかしくなっているのでしょうか？
再インストールしたほうがよいでしょうか？

グリフレットの更新は、外字を登録した時のみで、特段、変なことをしたような覚えはないのですが、
どなたか、わかる方がいらっしゃいましたら、よろしくお願いします。