質問に際して、kimさんがお使いのバージョンの情報をお忘れなく。

現状、InDesignでできることには限界がありますが、kimさんがどのレベルまで目指しているかにもよります。
こちらのHPにも情報がありますので読んでみてください。
StudyRoom CS4のNo.23縲鰀25、CS5のNo.23です。

いきさん、情報ありがとうございます。

現在のバージョンは、ＣＳ２，ＣＳ４です。

けっこう複雑なレイアウト（画像、図版、回り込みなど）を出来るだけ忠実に再現したいと思っています。

ＷＥＢの知識はＨＴＭＬの基本タグすら満足に覚えていない状況です。

ＷＥＢ制作も、もっぱらDreamweaverに頼っています。

頂いた情報を元に勉強したいと思います。ありがとうございました。

このHPだからということでURL書いてませんでしたが、念のため。
http://study-room.info/id/studyroom/cs4/study23.html

機能自体はCS3から追加されてはいますが、組版上の見せ方以外にもそれなりに注意点がありそうです。
なお、細かくコントロールしたければXHTMLとCSSについて勉強した方がよいかと。

いきさん、ありがとうございます。

XHTMLとCSSについては、知らない自分にとっては大変な作業になりそうです。

いずれ、手打ちではなく、ソフトウエアで操作出来る事を望んでいるのですが、おそらく無理かあと何十年もかかるような気がします。

そうこうしているうちに、自分は高齢になってしまうかもしれません。

そうならないうちに、時代に逆行するようですが、コマンドラインのような旧ＰＣの命令体系を、なんとか身につけたいと思います。

ありがとうございました。

kimさん、はじめまして。
私も電子書籍化で色々と悩んでいる者です。

◎iPadやiPhoneで、何をするかが重要だと思います。
（どのような機能を付加したいのか？　どのように使用・閲覧して欲しいのか？　など）
単に「見るだけ」の機能ならば、jpegやPDFで閲覧という方法もあります。
これならば、安価でレイアウトは崩れません。

◎iPadやiPhoneのどんなアプリで見てもらうのか？
も考えないといけないと思います。
上記のjpegやPDFならば、それらを閲覧するアプリをiPadやiPhoneに入れてもらう事になります。
また、アプリによっても機能が違ってきます。

◎作成したデータをどのように配布するか？
も考えないといけません。
専用アプリを開発してデータも配布・閲覧してもらうとなると、知識やお金や時間もかかると思います。

InDesignの［Digital Editions用に書き出し］はePub形式での書き出しとなりますので、XHTMLとCSSの勉強以前に、複雑なレイアウトの再現は現在では不可能かと思います。
（画像、図版、回り込みぐらいなら可能と思いますが...）

iPadやiPhoneがFLASHに対応するというウワサもありますが、もし対応すれば、InDesign→FLASHにして、webにて閲覧という方法も考えられます。

まぁ、いずれにしてもこの分野はまだ過渡期なので、あまりリスクやお金をかけない方法がいいのではないかと、私は思っています。
もしくは、詳しい会社と組むべきかなぁ......。