ラクをしたい場合、どういうラクをしたいかによって、索引のひろい方も作り方も変わるんだと思います。
文字スタイルを変換したり、出現順でソートしてチェックしたかったり、よみを自動で入れたかったり、同一語句をチェックしたり。。。
多くはJSやASなどのプログラムを書く必要があります。

基本的には、機能として実装されている、マーキングして読みを入力→ソートして書き出しというのは、
わりと一般的な方法だし、悪い方法ではないと思いますけど。