» 001
埋め込みで確認してください。
psdと同じ数値になりませんか？
画像をIllustratorにリンクで配置でpsdと見比べても色はIllustrator上ではあくまで見た目だけの再現かと。

» 002
たしかに、AI 上でスポイトで色を拾うと、違う値が出ますね。

AI 上での、スポイトの、おかしな値ですが、
AI の「カラー設定」を変えると、微妙に変わります。

そして、その（PSD ファイルが配置された）AI ファイルを、PSD 形式で「書き出し」して、それを PS で開いてみると、もとの CMYK の値が出ます。

以下推測ですが、スポイトの仕様の問題でしょうか。
RGB値がベースになってるとか、そんな風な。

» 003
PDFに変換してAcrobatの出力プレビューで確認した場合どうなんでしょ？

» 004
IllustratorのカラーモードはRGBになっていませんか？

Illustratorのカラーマネジメント実装はCS3になってもアマアマなので、プロファイル埋め込みの画像とかは使用しないほうがよいと思います。

カラー設定を5.5エミュレートでやってみたらどうでしょう。

» 005
カラーモードCMYK の AI ファイルに
カラーモードCMYK の PSD 画像ファイルを配置したとき、
AI 上で、スポイトで拾った CMYK 値が、
PS 上で、スポイトで拾った CMYK 値と違う、
ということですよね。

AI「カラー設定」で、RGB と CMYK の作業スペースのプロファイルの組み合わせを変えるとスポイトで拾われる値が変わる、ということから推測するに、
スポイトツールが CMYK ネイティブ（CMYK → CMYK？）でなく、
CMYK → RGB → CMYK みたいな変換を経ているということじゃないかと思います。

ちなみにライブトレースをつかって画像をオブジェクトに拡張したときも、
そのオブジェクトの値は、PSD の元の値でなくて、スポイトツールで出る値になりますね。

配置画像を埋め込むと、値はいくらか近くなりますけど、まったくおなじにはならないみたいですね。

（以上は CS2 OSX で試した結果です。）

私も解決法を知りたいです。

» 006
CS2～は解りません。
CS1であらためて簡単なカラーチャートを埋め込んで試しましたがやはり全く同じ数値に。
それを画像に書き出した場合は、埋め込んでも埋め込まなくても同じ結果。
結局仕様の問題かと考えています。
自分の場合、通常ほとんどリンクで作業。
スポイトツールで誤差があっても出力される版がリンクされた画像の数値になりますので
何ら問題は感じてません。

» 007
winでcs2ですが、
フォトショップで紺（C100,M100)、金赤（M100,Y100）、緑（C100,Y100）の3色だけのPSD作って、
イラレに配置→埋め込みで検証しましたが、
埋め込んだあとにスポイトでは完全に同じ色でした。
配置の段階では若干違う色でした。