もう終わった物件なので、全然急いでません。
環境は Windows Vista、InDesign CS3 (5.0.4) です。

図のように、表ばっかりの組版です。１行しかない各段落に、表が１つ入っています。そのうち本文？に相当する表が入っている段落は「base」という段落スタイルを当てています。また見出し？に相当する表が入っている段落には「head」という段落スタイルを当てています。この２つの段落スタイルの違いは、「head」は「base」のスタイルを元に、段落分離禁止オプションで、「次の行数を保持：１行」を加えているに過ぎません。
従って図の２段目の頭に見出しの表が来ているということです。３段目の頭に見出しの表が来ているのはたまたま本文に相当する表が段末まであったので、段落分離禁止オプションに関係なく頭に来ています。
ここでよく見ると２段目の頭の部分が１段目、３段目と比べてやや下がっています。その下がった状態はその段が終わるまで続きます。
これを何とか解消したくて、段落の設定や表の設定（主に表と段落のアキ）をいじってみたのですが、全く解消される兆しが見えません。（実作業では段落分離禁止オプションに引っ掛かるところはダミーの空白の表を挿入しました）

この挙動をどう捉えればよいのか、また、何か妙案がないかと思い投稿しました。
なお、このサンプルのデータは
http://omachi.blog.ocn.ne.jp/preopen/files/table_sample_CS3.indd
に置いてありますのでご自由に使ってください。