InDesign側の問題か、Acrobat（Adobe Reader）側の問題か、はたまたマシン環境の問題化を切り分ける必要があります。
ひとまず、InDesign → PDF書き出しに関してはこちらの情報を参照してください。
http://kb2.adobe.com/jp/cps/499/cpsid_49998.html
また、書き出す前にInDesignでプリフライトをかけてみて、検出されるエラーがないかどうか調べてみてください。

ところで、InDesignに貼ってある画像や、使っているフォント数はどのくらいでしょうか？

InDesignからの書き出し時には何のエラーメッセージも出ないし、2?3ページなら開くことができるとの書き込みを拝見すると、疑わしいのはマシンに積んである物理メモリのような気がしなくもないですが......、自信ないです。

＞いき様
お返事ありがとうございます。
教えていただいたページを見ながら、トラブルシューティングを行いましたところ、特に問題はなさそうでした。
プリフライトも問題なしです。
フォントは、モリサワのリュウミンR、M、中ゴとDF平成ゴシックW3、W5を使用してました。
写真やイラスト等はなく、文章中にたまに表が出てくる程度の報告書のようなものです。（透明効果等も使用していません）
トラブルシューティングでもしましたが、他のページもののファイルでも同様の動作でしたので、特定のファイル自体が壊れていることはなさそうです。
物理メモリの件ですが、どのくらいが悪いと判断できませんので、タスクマネージャーのパフォーマンスのSSを添付いたします。
自己解決で申し分けないのですが、取り急ぎ、納品しなくてはならなかったので、色々試してみたところ、macに入っているAcrobat8で編集できたので、修正して納品しました。
そのデータはwinのAcrobatやAdobe Readerでも問題なくひらけました。
ただ、原因のほうはわかっておりませんので、今後このような仕事がきたらとりあえずこの方法で乗り切りたいと思います。
貴重なお時間を割いていただいてありがとうございました。
また何かありましたら、よろしくお願いいたします。

ダイナフォントはTrueTypeですか？
「蚋巻日誌 2nd」さんの記述が参考になるかもしれません。
http://tacomakix.blog15.fc2.com/blog-entry-189.html

＞いき様
お返事ありがとうございます。
ダイナフォントはTrueTypeです。
誘導していただいたページより、
下記HPを参考にしましたところ、問題が解決いたしました！
http://blog.ddc.co.jp/mt/dtp/archives/20050822/154116.html
PSファイルにしてDistillerでPDFにしたところ、問題なくひらけました。
TrueTypeのダイナフォンはよく使用しますので、以後気をつけたいと思います。
大変助かりました。
教えていただいて本当にありがとうございました。

解決してよかったです。
私も該当URLを教えてもらったのですが、その方がたまたまここに書き込めなかったので、代理で書きこませていただきました。