» 001
参考までに当方MacOS9.22、イラレ9.02、Photoshop5.5の環境で検証してみましたが、問題なくPDF形式で保存できました。

» 002
実験ありがとうございます。例えばイラレで作ったロゴにぼかし影を付けるとします。
使用ソフト：イラレ9.02　Pho5.5

1）墨100の影素材に→背景透明でラスタライズ→フィルタ→ぼかし→ガウスをします。
2）何かフォトショップ画像を配置（ちなみにPho5.5のeps（jpgでもバイナリでもどちらでも）→丸でも四角でもいいからクリッピングマスクをかけます。
3）その画像の上にぼかし影つきのロゴを乗っけます。
4）pdf保存
5）マスク画像がおかしな事になっている。

こんな感じなのですが。いかがでしょうか。

» 003
>その画像の上にぼかし影つきのロゴを乗っけます。

仮にロゴを乗っけない状態ではどうですか？
ロゴを離して配置し、テストしてみてください。

下層のクリッピング画像と乗っけるロゴ（ぼかし影付）を1枚画像にするほうがいいかもヨ。

» 004
ぼかしつきロゴと配置画像とそれぞれ単体だときちんとpdfになるんです。
でも、2つが一緒になった時にｐｄｆにしたいのです。

1枚の画像にしてしまうか全部Phoデータにしてしまうのが一番無難なのはわかっているのですが、
イラレでガンガン修正もあるので、どうしてもこの組み合わせで使用したい場合なのです。
しかもｐｄｆも出せるようにしなければならなくて・・・・。

» 005
PDFのバージョンはいくつにしてるの？
透明効果に対応しているのはPDF1.4からだけど。

» 006
Acrobatｪ Distillerｪ 4.0です！
もしかしてバージョン！？

» 007
いや、Distillerのバージョンじゃなくって作成しているPDFのバージョン。

» 008
Acrobatｪ 4.0です。。。

» 009
いや、だから、、Distillerのバージョンじゃなくって作成しているPDFのバージョンだって。

それはそうと、ＰＤＦ（AI形式）で保存は出来ますよね？

» 010
イラレの9.0の別名保存で　Adobe PDF　を選んでファイルの互換性のところでAcrobat 5.0とAdobe Acrobat 4.0のチェックの所で4.0にチェックしてます。もしかして間違っています？
それか、PSファイルからディスティラーを使って変換。このどちらかの方法でいつもやっておるのですが。。。

» 011
それはPDF1.3。
PDFについてもう少し基本的な事から勉強した方がいいかも。

» 012
ありがとうございます。今までのコメントを元に調べたら、やっぱりpdfのバージョンですね。その通りでした。しかもOS9の環境では無理だという事も判明しました。OSXだとpdf 1.3～1.6まで選べるのですね。色々ありがとうございました。
答えが出たので、なんとか別の方法で対策をとる事を考えることにします。本当にありがとうございました！