» ＞均等ツメ文章の英数字のみトラッキングを解除（０）するソフト

う～ん・・・そういうソフトというものは聞いたことがないです。
ひとつひとつ地道に解除していくしかないかと・・・

＞縦組み文章中で二桁の数字を「縦中横」にしてくれるソフト

こういうソフトも聞いたことがないです。
やはり、ひとつひとつ地道に・・・

頑張ってください…としか言えません。
ごめんなさい・・・(^_^;

» ソフトが無いなら、スクリプトを書くしかないですね。アップルスクリプトかジャバスクリプトで、できるはずです。