画像の埋め込み

イラストレータの9.0以降は画像を埋め込みにしないと、予期しない出力結果になると話をきいたことがあるのですが、10.0はどうなのでしょうか？
確かに、10.0だと保存するときには、なんのメッセージも出てきませんし、リンクの状態で不具合に遭遇したこともないんですが…。
このまま作業を続けていて、ある日、突然、おかしなものが出力されるのも困ったものです。
どなたかよいアドバイスがありましたらよろしくお願いします。