別名で保存

画像の入稿でＭＡＣＯＳ－１０．３．９がインストールされている端末からイラストレーター６を使って作成した画像の取得を行って、Ｗｉｎｄｏｗｓ共有フォルダにコピーして使っているのですが、昔（ＭＡＣＯＳ９の頃）作っておいたファイルを別名で保存すると、変なファイルで作成されることがあります。あまり発生しないのですが、たまに発生して困っております。
ファイルの種類がエイリアスで、イラストレーターウィンドゥのヘッダに別名指定したファイル名とは違うファイル名が表示されます。ＭＡＣでは正常に開くことができ、ファイルサイズも４ｋｂｙｔｅ程度となっているのですが、これをＷｉｎｄｏｗｓ共有フォルダにコピーするとファイルサイズが０ｂｙｔｅとなってしまいます。なんどか別名で保存すると、ちゃんとファイルが作れました。
最近ＭＡＣＯＳ－１０．３．９にアップデートでしたので、ＯＳの問題のような気がするのですが、このような不具合をご存知の方いらっしゃいますでしょうか？