» 001
何をご使用されてPDFを作成されたか（バージョンも）
どんな文字が抜けたか
を追記されたら良いアドバイスを頂けるかと思います。

因にPDFを直接InDesignに配置して出力されたら同じ現象は発生しますか？

» 002
＞一太郎のデータをPDFファイルに変換して、
＞「別名で保存」でEPSに変換してCTPで出力したら、文字抜けが発生してしまいました。

原因ではなくて、作業の方法についてですが、普段扱い
慣れていないデータを出力する前は、感材に出す前に何
らかの確認手段（RIP のモニタプレビューとか）を使い
確認した方がいいです。

# RIP のモニタプレビューがあてにならないケースも
# ありますが（出力解像度に依存するものなど）。

＞因みにPDFの段階では、文字は埋め込まれてますし正常のファイルです。

そもそも PDF の作り方にも出力方法にもいろんな手法
があり、かつ、一太郎自身が PS をはき出す仕組みを
持っていたりするようですので、
http://slashdot.jp/comments.pl?sid=176295&cid=538658
どのような手法で PDF 化したか、とい
うのが原因究明の第１歩だと思います。

あと、PDF の時点で健全に見えても処理してみたらうま
くいかないっていうケースは結構ありますのであしから
ず。

» 003
皆さんアドバイスありがとうございます。

Justsystem PDF Createrを使ってPDFを作成しました。
抜けた文字は主に、「，．」です。

再度同じ方法で、PDF→epsにしてCTPで出力したところ、正常に出力されたのですが…

CTPで出力するために違うパソコンにデータを送ったときにおかしくなったと言うことも考えられるのでしょうか？

» 004
一太郎の場合、PS吐き出して、
Distillrtった方が確実じゃないかな