OS9環境での面付についてお聞きします。

製版屋さんに面付を頼むと高いとウチの営業が言うので自社で面付データを作っています。
この前MacOS9.2環境でA4, 中綴じ8Pのパンフレットの面付データを作ったのですが、デザイナーさんから支給されたイラストレータのデータが見開きになっていました。
今回はページが少なかったのでクリッピングマスクで１ページずつマスクして移動し、イラストレータで面付をしましたが、この方法だとオブジェクトにロックが掛かっていたり、ページが多くなると、危険かつ煩雑な作業になるんじゃないかと思いました。
クォークで面付云々という話をよく聞くので、後ほど自分でやってみたのですが、荒いビットマップでは位置が正確に合わず、クォークで発生させるトンボの上にイラレの描きトンボの一部が乗ってしまいうまくいきません。イラレのデータに色々手を入れないとうまくいかないようです。
OSX環境のインデザインならば、イラレの描きトンボを消してアートボードを正確に設定すれば正確な面付が可能ですが、OS9環境で作ったデータをOSX環境で仕上げるのはまだ少し不安があります。
皆さんはこういう時どのように面付されていますか？ よろしければ教えて下さい。