PDFについてお聞きしたい事が

複数のPDFファイルを1つにまとめるのでしたら、
サムネール（ページ）を一つのファイルのサムネールの欄にドラッグしてまとめるという方法もあると思います。

> 複数のPDFファイルを1つにまとめるのでしたら、

この他に、アクロバット６なら「文書－ページ－挿入」というコマンドがあります。
アクロバット５にも同様な機能のコマンドがあったはずです。

Acrobat 6.0 Professionalだったら、
　ファイル→PDFの作成→複数ファイル
でできますよ。

複数のPSファイルをDistillerにかける時に「RunDirコマンド」というコマンドを使うと、ひとつのPDFにまとめた状態で書き出させることもできます。