クィックドローのプリントアウトと違うフィルム

イラレ9で配置画像の上にドロップシャドウなどをつかった場合フィルムではプリントアウトと違う結果になりました。画像を埋め込むようにいわれましたが、解像度などに影響はでないでしょうか。また配置したときはリンクで100%になっているのですが埋め込むと24%になっていました。縮小したことはないのですがなぜでしょう。イラレ5.5や8の頃は配置でなければいけないといわれましたがイラレ9は違うのでしょうか。最終的にはフィルム出力で使うデータです。