> イラストレータ上で，縦組みの和文中にカンマ（，）が出てきます。
> テキストのままですと，カンマの位置が左下の方に行ってしまいます。
> これを防ぐにはどのような設定が正しいのでしょうか？
> また，入力をどのようにすればよいのでしょうか？

あの～、和文ですか？
縦組みの時には２バイトのカンマ・ピリオドは使いませんよ。
横組み時に、混在する可能性のある欧文（特に文献など）と合わせるために使用する
と、私は教わりましたよ。ってそういうことではなく？

どうやら，和文縦組みでのカンマはおかしいようですね。
先方に伝えて，修正させます。
ありがとうございます。