マスク処理を行うとレイヤーを移動してしまう

はじめまして。質問させていただきます。

Mac版イラストレーターCS2を使用しています。
複数のレイヤーにそれぞれオブジェクトがあり、
それらを最上位のレイヤーと最下位のレイヤーでマスク処理した際、
全て、同一階層のレイヤーに統合されてしまうことを回避できないでしょうか？

以前、イラストレーター8.0.1にて地図制作を行っている時は、
レイヤーを細かく分け、下から
・下地レイヤー
・緑地レイヤー
・河川レイヤー
・線路レイヤー
・道路Lレイヤー
・道路Mレイヤー
・道路Sレイヤー
・マスク枠レイヤー
として、最後に、下地レイヤーとマスク枠レイヤーで
サンドイッチした形でマスク処理をし、地図を作成していました。

同様のことがイラストレーターCS2ではできないようなのですが、
なにか解決法などご存知でしょうか？

宜しくお願いします。