Mac専用ですが、InDesign上で動作する孫リンクのファイルを収集するAppleScriptがあるようです。
試してみてはいかがでしょうか？

●InDesign(Mac)リンクファイル内のIllustrator配置画像収集: 生活向上ブログ
http://72.way-nifty.com/blog/2011/12/indesignmacillu.html

InDesignのパッケージだけではIllustratorに配置してある画像は収集しきれないので自作＆Illustratorサンプルスクリプト「CollectForOutput」を少し改変してInDesignとの複合技にしてみました！

※画像は http://72.way-nifty.com/blog/2011/12/indesignmacillu.html より

ご回答、ありがとうございます。
わかりやすいし同じことができる方法は他に知りませんので、
早速業務に取り入れてみようと思います。

やはりBridgeでは確認できないんでしょうか……。
できそうだなと思っていたんですが、
どこに表示があるかわからなかったのです。
一覧で確認できると便利なんですが……。

少し難しそうですが、スクリプトを使えば一覧を作ることができるんですね。

今データの復元の作業をしていて画像の取りこぼしがないか
不安になりこのような質問をさせていただきました。
使わない画像も多数残っているので、
同じ名前のファイルを張り替えるだけでは
余っている画像なのか孫リンクなのか判断がつきませんでした。

作業後にパッケージをして、その後、教えていただいた「InDesignの「CollectForOutput」」をかければOKですね！

丁寧に教えていただき、ありがとうございました。