「環境にないフォント」という警告メッセージ
こちらでも同じような話が掲載されています。
インデザインのCS3を使っているのですが、インデザインでページメーカーのドキュメントを開くと、AR行楷書体のフォントが出てこないようになってしまいました。
AR行楷書体は同じパソコンに入っている、筆まめのフォントで、インデザイン、ページメーカーのそれぞれを単独で開いた時には、フォントとして出てきます。
via Adobe Community: インデザインでページメーカーのドキュメントを開く際のフォントについて
フォントファイルの内部に含まれているフォント名の認識方法が変わったためだったと思います。
そもそもInDesignの文字パネルのフォントの部分に出てこない場合もありますし、出てきても内部的な解釈が違っていて、違うフォントと認識している場合もあるようです。
InDesignでフォントが見えているようであれば、再度設定するしかないかと思います。