InDesignに配置したaiデータの一部がPDF変換すると出力されない

広告代理店にて広告データをとりまとめて入稿しているデザイン担当者です。
いろいろ調べてみたのですがどうも解決できないため質問させてください。

取引先から送られてきたaiデータを含むInDesignデータを出力用のPDFにして印刷所に入稿をしています。
その際に、添付しているデータを含んだaiを配置したInDesignファイルからPDFに出力をすると、この部分だけが出力できません。
他にもグラデーションのかかった部分が印刷できないページがある等同じ事象が発生しており困っています。。。


このデータは、オブジェクトのアピアランスに不透明度　スクリーン　40%　というような指示が入っているので、恐らくは透明部分の指示が影響しているのかなと思い、それらしきものは検索してみたのですが、PDF1.4以降に設定したり、背景を透明をONにしたりと試したのですが、どれも効果がありません・・・
aiデータが直接ここに貼れればと思いましたが1M以下にすることが出来ず貼れませんでした・・・


どなたか解決策がわかる方いらっしゃいませんでしょうか・・・


よろしくお願い致します。