Acrobat Distiller（Adobe Acrobat 製品版に付属）を
つかうと、埋め込まなくても、「配置」のママで PDF
が作れます。これが PDF を作るときの本式です。

Illustrator 9.02 では、EPS 画像を「バイナリ」にす
る必要がなくなっています。

Illustrator の PDF 保存は、アップデータを適用して
いないととんでもない PDF を書き出しますし、縁取り
文字をアウトラインに変換したときに角が１カ所かける
ことがあるなど、注意するところがたくさんあるので気
をつけてください。

最新アップデータに関しては、
http://dtpwiki.jp/?%A5%BD%A5%D5%A5%C8%A5%A6%A5%A7%A5%A2%A4%CE%A5%A2%A5%C3%A5%D7%A5%C7%A1%BC%A5%BF%B0%EC%CD%F7
で確認できます（自動更新されません、現状と不整合が
あったら閲覧者が自分で直すタイプのページです）。

AI8で直接PDF作ると、フォントが変わったり、グリフが変わったり、いろいろと問題があります。
それを承知で使うのでない限り、直接PDF化するのは止めた方が良いと思います。

当方では、どうしても Acrobat Distiller が入手でき
ないお客様には、アウトライン化してから PDF に保存
してもらうやり方をしてもらっています。それといくつ
かのチェック項目を設けて、更に社内校正を鬼のように
行って、対応しています。

基本的には、Distiller を通してもらいたいと思ってい
ます。

ありがとうございます。