レイヤーの名前が変わってしまう

はじめまして、FAQやadobeのサポートも見たのですがよく分からなくて…
macで、IllustratorCS2でファイルを作って(拡張子は.ai)
そのファイルをwinで編集(Illustratorのバージョンは同じです)して、
またmacに持っていってさあやろう…と思ったら

・付けていたレイヤーの名前が全て「グループ」という名前になっている(一番初めのmacで名前をつけ、winでも名前は変わっていなかった)
・勝手にPDFファイルになっている(した覚えは無いです…多分…

macのOSはX、winのOSはXPです。
全く変わらない状態で、macで作り、winで編集、それをまたmacで編集は出来ないのでしょうか…
ファイルを移すのにはCDRWを使っています。

どうかよろしくお願いいたしますm(_ _)m