上書き保存が出来ないんです(TT)

　tkonkazと申します。
困った問題がありましたので皆さんの力をお借りしたく、
投稿します、よろしくお願いいたします。

　さて、問題ですが、、、
　Win2000上でIllustrator9.0.2を使っています。
同じソフトで以前に作ったファイルを開いて修正し、上書き保存をしようとすると「Adobe PDFファイル形式に問題があります」とダイアログが出て上書き保存ができません。
　また、その後ファイルを整理するためにWindowsで消去しようとすると「共有違反がありました、ファイルは使用中の可能性があります」と言って削除できません(TT)。
　名前を変えて保存をするとちゃんと保存できるので、少しの間ほっときましたが、後々の整理も問題ですし、HD容量も圧迫しますのでHELPします。
　もしかしたらどこかで答えが出ている問題なのかもしれませんが、、、何か情報ありましたら教えて下さいな。

　ファイルは外部のファイルサーバー代わりのPCに保存し、ネットワークで接続しています。そのPCはWin98SEでNorton以外は殆どソフトを入れていません。
　また両方のマシンで「＊.lst」はウイルススキャンから除外しています。

どうかよろしくお願いいたします。