OSX、CS3環境にて、フォントの管理

OS10.5.2、Illustrator CS3(13.0.3)環境です。
フォントの管理(停止方法)について伺いたいのですが、
現在、使用するフォントはOS標準のFontBookで管理しています。
Illustratorを使用していてふと気づいたのですが、
FontBookで使用停止にしているにも関わらず、そのフォントが
Illustrator上で表示されてしまっています。
もちろん消去すればIllustrator上には表示されないのですが、
CSの頃から使っていますが、こういった現象は初めてなので、
同じような環境下でIllustratorを使用している方がおられましたら、
このような現象はありませんでしょうか？
よろしくお願いします。