問題の「ある一部の画像」は
どんなファイルですか。

Photoshopからのeps PSDファイルやtiff形式など
Illustratorは様々なファイルを配置することが出来てしまいます。
一般的なjpegなども配置できます。


問題のファイルを「埋込み」するとどうですか？

一度PDF形式にして、Acrobat（リーダーは無料）からプリントするとどうでしうょか。

http://tu-kazu.jp/dtp2.php
すこし違うようですが
インデザインがらみではIllustratorCS1　には
こんなことがあるようです。

通りすがりa様　回答有難う御座います。
データはモードがCMYKの.epsファイルです。
説明不足ですいません。。。

ご指摘点、早速試してみましたがダメでした…
埋め込みにしたらイラストレーター上で
すでに色調が反転してしまいます。

PDFにしてプリントしても結局最初と同じ状態です。

> データはモードがCMYKの.epsファイルです。

Photoshopはありますか？変換ソフトがあれば・・

原因のファイルをpsd形式 pdf形式,tiff形式 ファイルなどに変換して張込むとどうでしょうか。



> 埋め込みにしたらイラストレーター上で
> すでに色調が反転してしまいます。

　やはり・・・これは予想通りでした。

通りすがりa様　フォトショップもあります。
画像をpsdに変換しイラストレーターに埋め込みをしたら
色調が反転しませんでした。
出力してもキレイに出てきたのでひとまず…
といったところです。
度々回答及びアドバイス頂き、有難う御座いました。

ちなみになぜこのようなことが起こるのでしょうか？
以前までは普通にできていたことなのでとても引っかかります。
何か心当たりなどありましたら教えて頂きたいです！

取り敢えずは良かったです。
理由はわかりません。
一度PDFにすれば印刷する前にチェックできるかもしれませんね。

紹介したリンクサイトではいろいろ考察しています。
私は偶然そこや、他の掲示板で画像反転の情報を知っていただけです。
http://tu-kazu.jp/dtp2.php
の一番したにあります。お読み下さい。

　IllustratorCS１とフォトシッョプのバージョンの関係を考察し
Illustrator10と比較して、
IllustratorCS１に問題があるのだろうか？と書いています。
　私もIllustratorCS１を使っているだけに心配です。
　そして
「データ入稿はai形式ではなくPDF形式がよいのでは」との提言も。

この問題がどうしよもないバグなら、
諦めて新しいバージョンの物を…と考えておりますが、
どうしても腑に落ちないため印刷会社の方と話をしながら
また何かあったらこちらの掲示板で報告したいと思います。

イラストレーターやフォトショップを5年ほど使用し、それなりに使いこなせると自負しておりましたが、まだまだ分からないことがあり奥が深いソフトだなと改めて思わされました。

自社でこういったソフトに精通している者がいない為
どうしようかと投稿させて頂いたのですが、
親身に回答を下さる方がいらしゃって本当に良かったです。

有難う御座いました。