アピアランスの線の処理

Illustrator上で直接縮小を行っているということでしたら、
環境設定や拡大・縮小パネルの「線幅と効果も拡大・縮小」のチェックが入っていないということが
考えられるところなので、確認を行ってみてください。

ただ、個人的な意見になりますが、縮小印刷としての処理でいえば、
直接縮小させるのはいろいろな意味で危険だと思いますので、
プリント時にオプションで縮小をかけるか、PDFにしてAcrobatで印刷されるほうがいいと思います。

あさうすさん、ありがとうございました！
解決しました！

印刷屋の面付けによっては、縦横を変えた場合アピアランスは
そのままの形で残るので最終データは「アピアランスの分割」をした方が
無用なトラブルを避けられます。