透過gifなどなど

はじめまして！
イラレ無しでは仕事が出来ないCS使いです。
いつもCSの反逆や暴走には1人で悩んできましたが、素晴らしい掲示板があると知り、早速愚痴かねがね、質問してみたいと思います。（解決しなくても私も悩んでる！っていうコメントだけでもかなり癒されますので、宜しくお願いします（笑））

ひとつは、イラレで作ったベクトルデータを透明GIFに変換したとき、周りに白い淵が勝手につけられることに困ってます。
今は、イラレでWeb保存した後、フォトショで開き、ちまちまと淵を消すという、気の遠くなるような作業をしていますが、もし「こうしたら良いのでは！」というアドバイスがありましたら、どうぞ宜しくお願いします。

それから、頻繁に泣かされるイラストレータの暴走について。
よく、ファイルを保存しようとすると、「すでに開かれているか誰か使ってます」と警告が出て、保存できません。
ポスターなど大きなものを作っているときに顕著に起こるので困ってます。（ファイル保存を忘れて、ファイルを閉じたときに、保存が出来なくて泣いたということが何度もあります、、、ToT)

同時に開いているフォトショップがあかんのかと思い、閉じてみたり、前の作業をまだ実は裏でしているのかもしれないと思い、作業をとめて数十分待ってまた保存を試みても駄目そうです。
これ、どうやったら回避できるでしょうか。
ちなみに、うちは私一人でやってる会社なので、ファイルの共有をするわけも無し、有線でルーターもつけているので不正アクセスがあるわけも無し、VersionCueも使ってません。
もし良いアイデアがありましたら教えてください。