複数ページを同ファイル内に作ることは可能ですが、IllustratorからのPDF保存では複数頁にはなりません。

＞後でPDFファイルにしたときに、スクロールしながら何枚も見る

これはAcrobatで開いてという意味ですよね。
Acrobat DistillerがあればPSデータの書き出しを使用してページ分けすることもできますがIllustratorだけではできないです。

ご説明いただきありがとうございます。イラストレーターのファイルに2つ以上の書類を作成できるとしても、書類の枠（名前がわかりませんが、B4ならB4の設定の用紙の枠）は2つ以上にはなりませんよね。わかりづらくてすみません・・・。結局のところ、香龍さんのおっしゃる通り、Acrobat Distillerを入手する必要がありそうですね。どうもありがとうございました。

＞書類の枠（名前がわかりませんが、B4ならB4の設定の用紙の枠）は2つ以上にはなりませんよね。

できますよ。
バージョンが書いてありませんので場所は違うかもしれませんが、（私は8.0なので）書類設定で『用紙サイズで区分ける』にチェック、アートボードのサイズを大きくする。（用紙設定を使用のチェックは外してください）でOK。
ページ番号が出た状態で区分けられるはずですが。

香龍さん、本当にありがとうございます！ページ設定の疑問がすっきり解けました。1つのファイルに2ページ分作成できました。なるほど、という感じです。そして確かに、Acrobatで開くと2ページをスクロールすることはできず、ドッキングした感じで表示されました。どうもありがとうございました。