透過処理

できますよ。
オブジェクトの透明指定もぼかしによる合成も。

どのような事がしたいのでしょうか？

スキャナで取り込んだ画像を透過処理したいのですが
バック部分の白い所を外して、色が付いてる画像部分のみ
保存したいのです。説明が下手ですみません

画像のバックを抜くには、
○PhotoShopでクリッピングパスをつけるか、
○PhotoShopで背景を消して透明にして、psd/gif等でIllustratorに配置するか、
○Illustratorでクリッピングマスクを掛けるか、
のどれかだと思います。
Illustaratorの『透明』で透過処理すると、画像全体に効果がかかってしまいますよね。

Illustratorのアートボード上、背景次第ですが
背景（オブジェクト）を写真に被せてもそれらしくはなりますね（切り抜きの逆）。