intel iMac 20inchで、InDesign CS、Photoshop7を使用していて
不具合がありました。
※動作確認対象外のバージョンなので、参考まで。

Photoshop7で画像をクリッピングパスで切り抜き、epsで保存。
それをInDesignCSに配置すると、切り抜きの位置がずれて表示されます。
psd形式で保存した時は問題ありません。