バージョンが明記してないので，私のマシンに入っているCSとCS2の場合だと，スウォッチをダブルクリックして出てくるダイアログで「カラー値を持つ名前」のチェックを外すと任意の名前がつけられます。

って，説明書ぐらい目を通しましょうよ。
というか，実際にInDesignを触っている方なら普通気づきそうなもんですが…。