はじめまして、いつも拝見させていただいております。
InDesign 1.0 での作業を検証中なのですが、現段階ではQuarkXPressがほとんどです。

当社は縦組・文字主体の組版が多いのですが、その中で「本文に注番号をふる」ということがよくあります。
・パーレンで数字をくくってあるもの
・マーク（★など）がついて数字のもの
の２種類で「２桁は１バイト数字で縦中横表示」です。
パーレンは２バイトのものを使います。

本文テキストが、赤字で動いても親文字と離れないように、
QuarkXPressでの作業では、１桁の時はルビ機能を使い、２桁の時はベースラインシフトとカーニングで処理していました。
InDesignでも１桁の場合はルビ機能を使い、２桁の時にベースラインシフトとカーニングをしてみました。
が、カーニングは -1000 しか設定ができないためパーレン付きの注番号では親文字の半分くらいにしか上がらず、
ベースラインシフトでは縦中横にした数字が上がりパーレンなどと重なってしまいます。
しかたなく、ルビ機能を使って２桁にしようとすると、１文字づつ起きてしまいます。

他によいやり方があるのでしょうか。
または、こういうときに使える数字の書体などあるのでしょうか。

長々と、すみませんがよろしくお願いします。